El Fonden es un instrumento financiero que permite a través de la Secretaría de Gobernación y el Sistema Nacional de Protección Civil, apoyar a las entidades federativas en la atención y recuperación de los efectos que produzca un fenómeno natural, cuando estos superen la capacidad financiera de respuesta de las autoridades locales.
Para aplicar dicho fondo debe reconocerse la situación como una declaratoria de emergencia o de desastre.
La emergencia se refiere al momento en que una región está ante el riesgo inminente de ser afectada por un fenómeno natural mientras que la declaratoria de desastre llega cuando hay daños en viviendas y servicios públicos de la población.
Con la primera, el Fonden dispone recursos para las necesidades alimentarias y de salud, enviando los recursos en especie y en la segunda se liberan recursos para reconstruir la infraestructura y restablecer los servicios básicos.
En el verano de este año en Mexicali ameritó la declaratoria de emergencia ante las altas temperaturas por lo que el Fonden envió botellas de agua y despensas para los afectados por el calor.